“SMA Kodo Ikusei Tokyo adalah sebuah sekolah idaman yang memiliki persentase 100% diterima perusahaan dan universitas, serta tiap siswanya akan menerima poin yang setara 100.000 Yen setiap bulan.
Namun pada kenyataanya, itu adalah sekolah yang menjunjung tinggi prestasi dan hanya sebagian kecil siswa dengan prestasi gemilang yang bisa mendapat perlakuan Istimewa tersebut.

Meski Ayanokoji dan teman-temannya berhasil naik ke kelas C di semester tiga kelas satu, tapi karena kalah tipis dari kelas A di ujian khusus terakhir, mereka pun harus turun lagi ke kelas D. Kelas dua pun dimulai kembali dari kelas D.

Setelah liburan musim semi, Ayanokoji menjalin hubungan romantic dengan Karuizawa, dan Horikita memutuskan untuk berhenti menjadi pribadi yang mengagumi kakaknya yang cerdas, Manabu. Di tengah hubungan social yang perlahan berubah, mereka naik ke kelas dua.

Ujian khusus pertama bagi Ayanokoji dan teman-teman yang baru naik ke kelas dua adalah ujian tertulis yang mengharuskan mereka berpasangan dengan siswa baru. Tetapi, di antara para siswa baru, ada asasin dari White Room yang telah disiapkan Tsukishiro.

Apa yang akan dibawa oleh hubungan melintasi angkatan ini? Badai atau ketenangan? Tirai kehidupan tahun kedua di sekolah, sekarang dibuka.”